Os Núcleos são equipes de referência em temas prioritários para a região, compostas por membros da Colansa que compartilham um interesse comum em um desses temas e desejam trabalhar juntos para desenvolvê-los. Os Núcleos produzem ações, documentos técnicos e treinamentos sobre seus temas e são responsáveis por consolidar informações, contribuir para o trabalho e coordenar informações e estratégias com as áreas de advocacy e pesquisa, e entre os Núcleos. A Colansa opera atualmente com quatro Núcleos:
